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莱氏无胆甾原体PCR 检测试剂盒使用方法

关 键 词
莱氏无胆甾原体PCR 检测试剂盒 ,莱氏无胆甾原体PCR 检测试剂盒
资料类型
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2020年04月17日 17:03
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上海一研生物科技有限公司
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资料简介

莱氏无胆甾原体PCR 检测试剂盒说明书

1、 试剂盒简介

 流行性造血器官坏死病,是由无囊膜胞浆型虹彩病毒科蛙病毒属的流行性造血器官坏死病毒

(EHNV)所引起的鱼类疾病。病鱼因肝脏、脾脏、肾脏造血组织和其他组织坏死而导致死亡。易感动物主要为赤鲈、虹鳟等种类,其中,赤鲈对该病毒极为敏感,幼鱼和成鱼都可受 EHNV 感染。EHNV 属于虹彩病毒科蛙病毒属(除新加坡石斑鱼虹彩病毒之外)病毒,本公司针对蛙病毒属的流行性造血器官坏死病毒( epizootic haematopoietic necrosis virus, EHNV)等病毒的主衣壳蛋白( MCP) 基因序列,开发生产了本试剂盒。应用本试剂盒进行检测具有快速、灵敏、特异、准确 、安全、操作简单、应用广泛等特点及优点。

2、莱氏无胆甾原体PCR 检测试剂盒 试剂盒组成

试剂盒组成包括核酸提取试剂和核酸扩增试剂,具体组成参见表 1:

表 1:试剂盒组成(50test/盒)

试剂盒组成成分 体积

核酸提取试剂: 样品 DNA 提取液 1

样品 DNA 提取液 2 5ml×1 管

500µl×1 管

核酸扩增试剂: DEPC 水

EHNV 荧光 PCR 反应液

Taq 酶(5U/ul) 阴性对照

EHNV 荧光阳性对照 5ml×1 管

750µl×1 管

40µl×1 管

1ml×1 管

1ml×1 管

*保存条件:样品 DNA 提取液 1、2 和试剂盒须在-20℃保存。

3、 样本采集,存放及运输

样本采集

采集活的或濒死的鱼的肾或脾等组织,研磨PBS稀释后提取核酸。或将细胞培养分离病毒的有CPE 的细胞悬液提取核酸病毒。

存放

研磨后的样本在 2 ℃—8 ℃条件下保存应不超过 24 h;-70 ℃以下可长期保存,但应避免反复冻融(最多冻融 3 次)。

运输

采用冰或泡沫箱加冰密封进行运输。

4、 莱氏无胆甾原体PCR 检测试剂盒 检测步骤

DNA 核酸提取操作方法(在样本处理区进行):

取 n 个 1.5ml 灭菌 Eppendorf 管,其中 n 为待检样品数、一管阳性对照和一管阴性对照之和, 对每个管进行编号标记。

每管加入 100 µl DNA 提取液 1,然后分别加入待测样本、阴性对照和阳性对照(阳性对照吸取前充分混匀)各 100µl,一份样本换用一个吸头;混匀器上震荡混匀 5 s,于 4℃~25℃条件下, 12 000 r/min 离心 10 min。

尽可能吸弃上清且不碰沉淀,再加入 10µl DNA 提取液 2,混匀器上震荡混匀 5s,于 4℃~25℃ 条件下,2 000 r/min 离心 10 s。

100℃ 干浴或沸水浴 10 min;加入 90µl DEPC 水,12 000 r/min 离心 10 min,吸取上清, 即为提取的 DNA,冰上保存待用(提取的 DNA 需在 2 h 内进行 PCR 扩增或放置于-70℃冰箱内保存)。

荧光 PCR 检测

扩增试剂准备(在反应混合物配制区进行):

从试剂盒中取出荧光 PCR 反应液、Taq 酶,2000×g 离心 5 秒钟。每个样品测试反应体系配制见下表 2。

表 2 每个样品测试反应体系配制表

试剂 荧光 PCR 反应液 Taq 酶 合计

用量 14.5 μL 0.5μL 15μL

加样(样本处理区进行):

向每个PCR 管中各分装15μL 的混合液,再分别加入样本DNA 模板10μL,盖紧管盖,500 r/min

离心 30 s。

荧光 PCR 检测(在检测区进行): 循环条件设置:

一阶段,94 oC /4 min;

莱氏无胆甾原体PCR 检测试剂盒 第二阶段,95oC/15 s,60 oC/60 s; 40个循环;在每次循环的60 oC退火延伸时收集荧光。试验检测结束后,根据收集的荧光曲线和Ct值判定结果。

5、 结果判定

结果分析条件设定

直接读取检测结果。阈值设定原则根据仪器噪声情况进行调整,以阈值线刚好超过正常阴性样品扩增曲线的最点为准。

质控标准

5.2.1阴性对照无Ct值或无扩增曲线。

5.2.2阳性对照的Ct值应<28.0,并出现典型的扩增曲线。否则,此次实验视为无效。

结果描述及判定

5.3.1阴性

无Ct值或无扩增曲线,示样品中无EHNV核酸。

5.3.2阳性

Ct值≤30,且出现典型的扩增曲线,示样品中存在EHNV核酸。为进一步确诊是EHNV,建议用普通PCR进行确认或测序。

5.4 有效原则

Ct>30的样本建议重做。重做结果无数值者为阴性,否则为阳性。

6、 相关技术信息

MCP-153F: 5’-TCACCAAGCTGCCGTCTCT-3’ MCP-215R:5’-AAAACTGCTGCCCGAAAGC-3’

MCP-175T: (FAM)5’-CGCCAAGATGTCGGGCAACCC-3’(TAMR


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