通常来说，一根毛细管色谱柱由两部分组成—管身和固定相。管身一般使用熔融二氧化硅或不锈钢作为基本材质：而固定相种类就有许多了。大部分的固定相是液体或胶状的高分子量，具有高热稳定性的聚合物，zui常用的是聚硅氧烷（有时误称为硅氧烷）和聚乙二醇，另外还有一类是小的多孔粒子组成的聚合物或沸石(例如氧化铝、分子筛等)。
　　
　　毛细管柱的安装方法：
　　
　　建议配戴防护眼镜！
　　
　　1、关闭检测器，等待其冷却。
　　
　　2、检查载气.燃气和尾吹气气源，保证气体压力和纯度。
　　
　　3、清洗进样口衬管。
　　
　　4、更换密封衬垫和进样隔垫。
　　
　　5、设定检测器的气体流速，包括尾吹气量。
　　
　　6、检查色谱柱有无损坏。
　　
　　7、切除色谱柱一端1－2厘米，保证切口朝向下，安装上卡套和螺母（使用正确尺寸的卡套并且保证正确的安装朝向）。
　　
　　8、再切除1－2厘米的柱体（注意切口的平滑和洁净），用以去除柱口中的卡套碎屑。
　　
　　9、在柱箱中安装色谱柱，有柱悬挂架时请使用柱悬挂架。注意避免色谱柱的锐折。
　　
　　10、查看《GC系统操作手册》，正确的安装距离（即进样口色谱柱伸出螺母1-2mm,检测口插入底部拔出1-2mm），并在色谱柱上用打印机涂改液作出标记。一般情况下，色谱柱的顶端应保持在进样口衬管的中下部，当进样针穿过进样隔垫*进入进样口后，针头与色谱柱头保持1－2厘米的距离为理想的进样状态。将色谱柱插入进样口，用手拧紧螺母直至色谱柱固定，然后在拧紧螺母1/4－1/2周。
　　
　　11、打开载气，按照仪器测试要求设定柱头压力.分流比和尾吹周期。
　　
　　12、将色谱柱出口端浸入无毒溶剂中（丙酮）观察是否有气泡产生。
　　
　　13、通入载气20min左右，清洗系统中的残氧。如果色谱柱打开后暴露在空气中已经很长时间，则需要更长时间（1－2hour）来清洗系统。
　　
　　14、重复7.8步骤，按照《GC系统操作手册》的安装尺寸，将色谱柱安装在检测器的进口处。
　　
　　15、在加热色谱柱前，检查GC系统有无泄漏处。建议不要使用肥皂液，避免其从泄漏处渗入系统中。使用热导型的渗漏探测器是有效的探漏方法之一，如果一定要使用液体捡漏，建议使用异丙醇/水混合液（50/50）。
　　
　　16、设定检测器温度，加热至温度稳定后打开检测器。注意：在设定气体通过的状态下，直接加热检测器是会损坏检测器，甚至发生危险！
　　
　　17、在比zui高连续使用温度高20℃或zui高柱温的条件下老化色谱柱2hour。如果在高温10min后，背景不降低，应立即降温检查系统有无泄漏。
　　
　　18、注射不保留物质，测定死时间和气体流度。按照样品分析方法调整气体压力。
　　
　　19、使用正常柱温，注射另外一种不保留物质。重新设定载气流速。
　　
　　20、注射已知样品，评价系统性能。如果峰拖尾，系统中的了；连接可能松动.或者色谱柱安装不正确.或者衬管破裂。
　　
　　21、校正仪器。