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推动行业转型升级 | 百迈客携手珀金埃尔默打造NGS全自动化实验生产线

阅读:675      发布时间:2022-6-30
  在我国“十四五规划”的国家战略中,生命科学被纳入引领性科技领域的重点攻关项目。其中,基因与生物技术领域重点研究包括基因组学应用、遗传细胞和遗传育种、合成生物、生物医药等技术创新与研发。这为基因测序技术在中国的发展带来重大机遇。从全球公共卫生事件的病原追踪、重大疾病的筛查诊断及治疗的临床需求端到基于NGS技术进行的生物物种基因组学研究、遗传群体育种研究的科研服务端,市场需求都在不断发展和扩容。如何推动NGS技术在科研服务领域的产业转型升级,助力行业高质量发展成为摆在行业内企业和研究者们面前的发展战略问题。
 
  作为中国基因测序领域的企业,百迈客(Biomarker)为了更好地满足客户需求,于21年9月引进explorer™ G3全自动超高通量NGS(二代测序)文库构建系统,其高度集成化与智能化的自动化设备,在无人或人工干预极少的情况下,按照程序指令自动进行样本制备、文库制备、文库质检、信息处理等流程,配套成熟的流程控制和分析软件,在智能化、高通量、自动化和数字化方面优势突出,可大大提高效率,降低操作难度。
 
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  百迈客生物NGS全自动化实验生产线在2021年9月份搭建完成并通过测试;2022年1月份,产线按照规划设计指标进行了多方位验收,验收结果达到合同指标要求。截至发稿,共完成微生物扩增子样品3万例以上,二代微生物扩增子建库单流程通量可达1520例样品/天;三代微生物扩增子建库单流程通量可达1900例样品/天;微生物扩增子建库流程自动化占比达到70%以上,一次建库成功率稳定在90%以上、产出波动性CV值比手工降低18%、实验交付周期平均缩短20%以上。
 
  一套能完成扩增子建库的全自动化实验生产线
 
  百迈客通过大量的实验积累和优化,力推二代微生物扩增子项目和三代微生物扩增子项目上线,目前测试成功的业务线包括:16S全长,16S V3+V4,ITS1等常见扩增区域;而普通转录组和重测序等项目,早期就已经在自动化液体工作站上进行大量技术积累,为顺利整合到全自动化实验生产线提供了极大助益。
 
  更智能
 
  配合LIMS系统,实现自动下单,接收订单后自动进行时序规划,自动启动任务,系统记录试剂耗材用量并进行预警提醒,真正做到无人值守,24小时不间断运行。系统采用先进的设计理念,通过条码管理96孔板的整个“生命周期”,每一块板自“出生”就带有唯一条形码,条码全程可追溯,通过实时甘特图可清楚的看到该条码所在的设备,和正在进行的实验步骤,一系列不同条码的孔板从自动化冰箱或储板栈里推出,通过智能柔性机械手臂搬运到产线上各个自动化设备,最终再回到自动化冰箱或储板栈。组成了我们的全自动化实验标准步骤。
 
  高通量
 
  产线配套4台PCR扩增仪,2台核酸片段分析仪,可使用384孔模式进行检测,预计24小时内可完成1536个样品(16板)。然而,追求高通量远不止如此,明年1月,将启动通量升级,扩展到8台PCR仪,3台自动化片段分析仪,通量再翻倍。
 
  信息自动化
 
  LIMS与自动化系统流程控制软件无缝衔接,LIMS下单可直接启动系统执行生产任务,产线在实验过程中产生的检测结果数据,可直接回传到LIMS。使用微流控技术进行毛细管电泳,生成电子胶图和峰图取代传统电泳图,而且可批量导入电子图片名称,摆脱了常规电泳制胶、染胶、照胶等繁琐步骤。
 
  至此,百迈客贯通了从样本提取到检测、建库、质检、出报告的实验全流程自动化,信息化。
 
  曾几何时,我们欣喜于日益增涨的测序需求,也困惑于实验自动化设备匮乏与滞后,今天百迈客站在了新的起点之上,结合自动化智能化为科研行业带来更好的服务。
 
  关于百迈客生物
 
  百迈客生物(BioMarker)成立于2009年5月,是一家高新技术企业,公司基于功能基因组学的BT+IT(高通量基因测序技术、生物信息技术、高性能生物云计算技术)技术,拓展出了科技服务、生物云、智能制造三大业务板块;拥有以博士和硕士为主体的研发、生产团队;公司自成立以来,注重创新发展,科研成果成果层出不穷,先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等国际著名期刊上发表高质量合作文章近千篇,累计影响因子超过4500分。拥有国家发明专利技术60余项,软件著作权近200项。公司拥有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的测序平台,满足科研工作者多种科研需求,努力打造基因产业国际一流企业,“为世界创造新的可能!”
 
  关于珀金埃尔默
 
  珀金埃尔默是知名的端到端解决方案提供商,帮助科学家、研究人员和临床医生更好地诊断疾病、发现新的个性化药物、监测食品的安全与质量,并推进卓越的环境及应用分析。85年来,珀金埃尔默秉承为打造更健康的世界而持续创新的使命,不断推动科学技术的进步。在全球,我们拥有16,000多名专业人员,与商业、政府、学术及医疗健康领域的客户保持密切合作,为之提供涵盖仪器、试剂、检测方法、自动化、信息化和战略服务的全面解决方案,助力客户加快工作流程,制定更好的决策。珀金埃尔默于1978年进入中国,并建立了覆盖研发、生产、销售与服务的完整价值链,以先进的产品和解决方案助力中国科研及医疗健康领域的创新突破。

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