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Microwell-seq技术:研究证实可用于绘制细胞表达图谱

时间:2020-11-30阅读:82
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  浙江大学一项新研究运用microwell-seq技术绘制了世界上张哺乳动物细胞表达图谱——小鼠细胞表达图谱。Microwell-seq技术是一种便捷、高效、便宜、稳定的高通量单细胞RNA测序技术,其核心耗材为杭州晶佰生物科技有限公司旗下产品Microwell-Seq 高通量单细胞RNA测序试剂盒(Microwell-seq High-throughput Single Cell RNA-Seq Kit, Order No.SC-809-001) /research_detail/dxbcp/microwell.html。
 
  2018年2月22日生物学期刊《cell》刊登了浙江大学教授郭国骥团队的一项新研究成果。该研究运用Microwell-Seq 高通量单细胞RNA测序试剂盒对来自小鼠 51种器官组织的40余万个细胞进行了系统性的单细胞RNA测序,数据分析后完成了世界上张哺乳动物细胞表达图谱——小鼠细胞表达图谱。
 
  Microwell-Seq技术进行单细胞RNA测序的流程主要包括单细胞RNA捕获和测序两大部分。Microwell-Seq技术中用琼脂糖微孔板进行单细胞分离,实验过程中确保每个微孔中多有一个细胞;然后加入带有特异性标签的磁珠,确保每个微孔中有一个磁珠;接着在微孔中进行细胞裂解,将mRNA捕获在磁珠上;收集磁珠后进行cDNA合成与高通量测序。该技术确保单个细胞mRNA都只同一种特异性标签,进而真正实现单细胞测序和单细胞转录组分析。
 
  与现有的单细胞分离技术相比,Microwell-Seq 高通量单细胞RNA测序试剂盒有显著的优势。试剂盒配套的琼脂糖微孔板含有10万个微孔,单块微孔板一次能分离5千-1万个单细胞,实现了高通量单细胞分离。单细胞分离的关键耗材琼脂糖微孔板以廉价琼脂糖为原料,可重复利用PDMS板为模板制备,*降低了单细胞分离成本,可将单细胞的测序成本降到0.02美元以下,有利于Microwell-Seq技术的全面推广应用。
 
  澎湃新闻报道指出Microwell-Seq技术平台的建立必将推动单细胞测序技术在基础科研和临床诊断的普及和应用。同时小鼠细胞图谱的完成也将对下一步人类细胞图谱的构建带来指导性的意义,并惠及细胞生物学、发育生物学、神经生物学、血液学和再生医学等多个领域。

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