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299次基酸是蛋白质主链的结构单元，普遍含有胺和羧酸官能团。游离氨基酸的血液检测在新生儿筛查程序中先天性代谢异常的早期检测中具有重要的作用。另外，在食品工业领域已增加了氨基酸的检测，同时要求产品质控分析。
使用传统的柱前或柱后衍生及紫外检测器的HPLC分析技术，是分离样品中氨基酸含量的常用手段。然而，衍生化操作增加了不必要的样品制备步骤。使用质谱作为检测器能够对重叠峰进行自动解析，并大大提高了HPLC的分析速度。
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